Nutrición y Metabolismo
Plataforma metabolómica
Miembros del equipo
Responsable
Xavier Correig Blanchar
Investigador/a Postdoctoral
- Esteban Del Castillo Pérez
- Jesús Brezmes Llecha
- Nicolau Cañellas Alberich
- Noelia Ramírez González
- Oscar Yanes Torrado
- Sara Samino Gené
Investigadores colaboradores
- Maria Vinaixa Crevillent
- Radu Ionescu
- Raquel Cumeras Olmeda
Técnico
- Serena Pujol Paulí
Personal en formación
- Daniel Cañueto Rodríguez
- Dídac Vilalta Montlleó
- Jordi Capellades Tomàs
- Josep Gómez Álvarez
- Josep Mª Badia Aparicio
- Miriam Navarro Sanz
- Pere Ràfols Soler
- Ruben Barrilero Regadera
- Sònia Torres
- Xavier Domingo Almenara
Objetivos
La Plataforma Metabolómica tiene por objetivo principal desarrollar técnicas metabolómicas y aplicarlas en los ámbitos de la biomedicina y la biotecnología, trabajando como un laboratorio integrado, donde se definen objetivos, dimensión y características tanto del conjunto de muestras como de los diseños experimentales. Los datos experimentales son procesados por nuestro equipo humano, y facilitamos la interpretación de resultados, aportando conclusiones clínicas sólidas, relevantes y útiles para los diferentes grupos de investigación. El equipamiento actualmente disponible en el campo NMR y LC / GC-MS permite análisis a gran escala de fluidos corporales (por ejemplo suero u orina), así como tejidos o biopsias de pacientes y / o modelos animales. El uso de estadística avanzada, quimiometría y algoritmos multivariantes permite transformar un elevado conjunto de datos en perfiles metabólicos, y en última instancia a información clínica. Nuestro objetivo es el de introducir la metabolómica como una herramienta de investigación complementaria tanto para diagnósticos clínicos como para elucidar los mecanismos desconocidos asociados a una determinada enfermedad. La Plataforma Metabolómica está especialmente dirigida a las necesidades de los Grupos de Investigación del CIBERDEM y de la URV, pero las potenciales colaboraciones científicas también están disponibles para otros Grupos CIBER.
Línias de investigación
- Análisis de lipoproteínas por RMN. Identificación y cuantificación de la concentración y dimensiones de subclases de lipoproteínas, así como del contenido en lípidos, a partir de experimentos de difusión en RMN.
- Fingerprinting y perfil metabólico de muestras de suero, orina y otros fluidos biológicos. Clasificación y diferenciación de muestras. Identificación y cuantificación relativa de metabolitos en biofluidos a partir de espectros RMN y/o de espectrometría de masas (GC-MS y LC-MS).
- Perfil metabólico de tejidos, cultivos celulares y/o biopsias. Identificación de metabolitos a partir del análisis de la muestra biológica intacta (HR-MAS-NMR) o a partir de extractos acuosos y/o lipídicos.
- Desarrollo de algoritmos bioinformáticos de aplicación a ciencias ómicas. Desarrollo de algoritmos de preprocesamiento (alineamiento de picos, eliminación de banda base, selección de variables, normalización, etc.). Diseño de algoritmos de reconocimiento de patrones supervisados y no supervisados, de aplicación en entornos biológicos, donde la variabilidad de las muestras es elevada y coexisten simultáneamente diferentes factores. Fusión de datos provenientes de diferentes entornos (genómica, transcriptómica, metabolómica, etc.).
- Isotopomeros no radiactivos para el estudio del perfil metabólico y su flujo en cultivos celulares y modelos animales.
- Desarrollo de nanoteconologías por NIMS y alogaritmos de procesado de imágenes metabólicas de tejidos.
